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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
28/08/2007 |
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Data da última atualização: |
17/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SIMÕES, M.; BAHIA, D.; ZERLOTINI, A.; TORRES, K.; ARTIGUENAVE, F.; NESHICH, G.; KUSER, P.; OLIVEIRA, G. |
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Afiliação: |
MARIANA SIMÕES, Fiocruz; DIANA BAHIA, Fiocruz; ADHEMAR ZERLOTINI, Fiocruz; KLEIDER TORRES, Fiocruz; FRANÇOIS ARTIGUENAVE, Inra; GORAN NESHICH, CNPTIA; PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA; GUILHERME OLIVEIRA, Fiocruz, Santa Casa de Belo Horizonte. |
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Título: |
Single nucleotide polymorphisms identification in expressed genes of Schistosoma mansoni. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular and Biochemical Parasitology, v. 154, p. 134-140, 2007. |
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DOI: |
10.1016/j.molbiopara.2007.04.003 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Single nucleotide polymorphism (SNP) markers have been shown to be useful in genetic investigations of medically important parasites and their hosts. In this paper, we describe the prediction and validation of SNPs in ESTs of Schistosoma mansoni. We used 107,417 public sequences of S. mansoni and identified 15,614 high-quality candidate SNPs in 12,184 contigs. The presence of predicted SNPs was observed in well characterized antigens and vaccine candidates such as those coding for myosin; Sm14 and Sm23; cathepsin B and triosephosphate isomerase (TPI). Additionally, SNPs were experimentally validated for the cathepsin B. A comparative model of the S. mansoni cathepsin B was built for predicting the possible consequences of amino acid substitutions on the protein structure. An analysis of the substitutions indicated that the amino acids were mostly located on the surface of the molecule, and we found no evidence for a significant conformational change of the enzyme. However, at least one of the substitutions could result in a structural modification of an epitope |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática; Comparative modeling; Computational biology; Polimorfismo de nucleotídeo único. |
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Thesagro: |
Schistosoma Mansoni. |
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Thesaurus Nal: |
Bioinformatics; Cathepsin B; Models; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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005 2020-01-17
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 173 | |
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| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 4. | | CONCENCO, G.; STAUT, L. A.; SILVA, C. J. da; CORREIA, I. V. T.; VIEIRA, L. C. Y; GALON, L. Análise de crescimento de crambe na presença ou ausência de competição interespecífica. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 28., 2012, Campo Grande. A ciência das plantas daninhas na era da biotecnologia: anais. Campo Grande: SBCPD, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 5. | | CRIVELARO, J. C. B; CARVALHO, D. A. de C. A.; MATRANGOLO, W. J. R.; SILVA, C. J. da. Anatomia e histoquímca do caule de Cratylia argentea (Desv.) Kuntze (Fabaceae-Papilionoideae). In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 67., 2016, Vitória. Conectando diversidades, revelando o desconhecido: [resumos]. Brasília, DF: Sociedade Botânica do Brasil, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 8. | | MATRANGOLO, W. J. R.; BRASILEIRO, B. P.; SILVA, C. J. da; NETTO, D. A. M.; MATTAR, E. P. L.; FRADE JÚNIOR, E. F.; SILVA, I. H. F. da; SILVA, I. S. da; CRIVELARO, J. C. B.; RIBEIRO, J. P. O.; FERRAZ, L. de C. L.; COSTA, L. S. C.; MALTA, P. da C. C.; CRUZ, S. C. B. da; GOMES, S. X.; GONÇALVES, V. A. D. Aspectos de Cratylia argentea na região central de Minas Gerais e potencialidades em sistemas agrobiodiversos. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2018. 41 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Comunicado Técnico, 233).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 9. | | KURIHARA, C. H.; LIMA FILHO, O. F. de; SILVA, C. J. da; KIKUTI, H.; BINOTTI, F. F. da S. Aspectos nutricionais em pinhão-manso. In: LAVIOLA, B. G.; RODRIGUES, E. V. (Ed.). Pinhão-manso: pesquisas, conhecimentos e práticas. Brasília, DF: Embrapa, 2019. P. 204-227| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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| 10. | | PORTILHO, I. I. R.; SILVA, A. O. da; PAREDES JUNIOR, F. P.; SILVA, C. J. da; MERCANTE, F. M. Atributos microbiológicos do solo em cultivos de pinhão-manso consorciados com diferentes espécies vegetais. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 30.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 14.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 12.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 9.; SIMPÓSIO SOBRE SELÊNIO NO BRASIL, 1., 2012, Maceió. A responsabilidade socioambiental da pesquisa agrícola: anais. Viçosa: SBCS, 2012. Fertbio. Organizado por Leila Cruz da Silva, Gilson Moura Filho, Adriano Barboza Moura, Abel Washington de Albuquerque. 4 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 12. | | BOTTEGA, S. P.; SILVA, C. J. da; SOUZA, L. C. F. de. Avaliação da eficiência de herbicidas aplicados em pós - emergência na cultura do girassol. In: CONGRESSO DA REDE BRASILEIRA DE TECNOLOGIA DE BIODIESEL, 4.; CONGRESSO BRASILEIRO DE PLANTAS OLEAGINOSAS, ÓLEOS, GORDURAS E BIODIESEL, 7., 2010, Belo Horizonte. Biodiesel: inovação tecnológica e qualidade: anais: trabalhos científicos. Lavras: UFLA, 2010. v. 1 p. 563-564| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 13. | | BOTTEGA, S. P.; SILVA, C. J. da; SOUZA, L. C. F. de. Avaliação do comportamento agronômico do crambe em função de dois espaçamentos ente plantas. In: CONGRESSO DA REDE BRASILEIRA DE TECNOLOGIA DE BIODIESEL, 4.; CONGRESSO BRASILEIRO DE PLANTAS OLEAGINOSAS, ÓLEOS, GORDURAS E BIODIESEL, 7., 2010, Belo Horizonte. Biodiesel: inovação tecnológica e qualidade: anais: trabalhos científicos. Lavras: UFLA, 2010. v. 1 p. 551-552| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 14. | | SILVA, C. J. da; TOPPA, E. V. B.; ZOZ, T.; GERHARDT, I. F. S.; ZANOTTO, M. D. Avaliação do desempenho produtivo de acessos de cártamo sob condições de safrinha. CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 5.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 2.; FÓRUM CAPIXABA DE PINHÃO-MANSO, 1., 2012, Guarapari. Desafios e Oportunidades: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2012. 353| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 15. | | SILVANETO, J. A.; LANGE, A.; SILVA, C. J. da; NOETZOLD, R.; DARDENGO, L.; KAPPES, C. Avaliação do ph do solo em resposta a diferentes plantas de cobertura na amazônia Mato-grossense. In: SEMINÁRIO DE EDUCAÇÃO PARA O DESENVOLVIMENTO SUSTENTÁVEL DA AMAZÔNIA MERIDIONAL, 4., 2009, Alta Floresta. Biodiversidade e sustentabilidade: livro de resumos. Alta Floresta, MT: Universidade do Estado de Mato Grosso, Campus Universitário de Alta Floresta, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 17. | | SANTOS, S. A. dos; ALVES, M. E. dos S.; PALHARINI, W. G.; MARSCHALL, I. R.; MARQUES, R. F.; SILVA, C. J. da; CONCENCO, G. Banco de sementes de plantas daninhas em áreas de pinhão-manso consorciado com culturas nas entrelinhas. In: JORNADA DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA, 2014, Dourados. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2014. 1 CD-ROM; JIPE 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 18. | | JESUS JUNIOR, E. de; SILVA, C. J. da; KURIHARA, C. H.; STAUT, L. A.; TOMAZI, M. Bioindicadores de qualidade do solo após o uso de culturas de cobertura na reforma de canavial, em Caarapó, MS. In: JORNADA DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA, 2019, Dourados. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2019. JIPE 2019| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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